More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0620 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
389 aa  787    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.73 
 
 
382 aa  500  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
386 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
386 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.9 
 
 
384 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.75 
 
 
388 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.75 
 
 
388 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.22 
 
 
388 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.22 
 
 
390 aa  454  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.07 
 
 
386 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.73 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.7 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.28 
 
 
386 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  55.99 
 
 
392 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.19 
 
 
391 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.28 
 
 
386 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.99 
 
 
391 aa  448  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  55.73 
 
 
392 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.54 
 
 
386 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.73 
 
 
390 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.96 
 
 
392 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  54.92 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.59 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.59 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.33 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.07 
 
 
389 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  54.66 
 
 
390 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.81 
 
 
386 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.93 
 
 
391 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  54.66 
 
 
390 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.81 
 
 
386 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.81 
 
 
386 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  54.29 
 
 
392 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.24 
 
 
388 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.09 
 
 
386 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.09 
 
 
386 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  51.93 
 
 
395 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.31 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.29 
 
 
388 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.89 
 
 
392 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.07 
 
 
386 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.04 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.59 
 
 
386 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.36 
 
 
388 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 
389 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.36 
 
 
388 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 
389 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.29 
 
 
386 aa  425  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.71 
 
 
388 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.21 
 
 
387 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.95 
 
 
386 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.08 
 
 
399 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.31 
 
 
388 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 
385 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.45 
 
 
387 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 
388 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.51 
 
 
386 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.01 
 
 
400 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.51 
 
 
389 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 
385 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.28 
 
 
399 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 
389 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.98 
 
 
388 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.48 
 
 
388 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.81 
 
 
399 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.26 
 
 
387 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.33 
 
 
388 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  52.32 
 
 
389 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.88 
 
 
403 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.22 
 
 
389 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.28 
 
 
397 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.99 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.74 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.91 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.03 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.38 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  53.21 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.78 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.45 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  53.99 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.91 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>