More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3392 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 		 386 aa  782    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  84.72 
 
 		 388 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  87.31 
 
 		 386 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  94.3 
 
 		 386 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 		 386 aa  782    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  87.56 
 
 		 386 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  87.31 
 
 		 386 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  88.86 
 
 		 386 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  89.12 
 
 		 386 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  83.42 
 
 		 388 aa  618  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2730  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  80.93 
 
 		 388 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  85.56 
 
 		 386 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.61 
 
 		 386 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.34 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.13 
 
 		 389 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.66 
 
 		 389 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.35 
 
 		 386 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.33 
 
 		 388 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.06 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.01 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.06 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.74 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.74 
 
 		 389 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.13 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.06 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.06 
 
 		 388 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.06 
 
 		 388 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.33 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.53 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.27 
 
 		 388 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.27 
 
 		 389 aa  544  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.73 
 
 		 388 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.58 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.8 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.28 
 
 		 386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.47 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.16 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 		 386 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.16 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.18 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.64 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.18 
 
 		 388 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  61.66 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.64 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.12 
 
 		 410 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  60.61 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.36 
 
 		 399 aa  484  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.47 
 
 		 389 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.61 
 
 		 403 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.1 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.31 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.87 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.62 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.35 
 
 		 397 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.6 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.34 
 
 		 397 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.36 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.16 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 		 398 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.16 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.84 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  64.68 
 
 		 386 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.86 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.84 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.37 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.08 
 
 		 397 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.9 
 
 		 389 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.16 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 		 398 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.11 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.11 
 
 		 398 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.86 
 
 		 398 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.24 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.59 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.61 
 
 		 398 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.85 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4127  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.61 
 
 		 398 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.64 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.64 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  63.12 
 
 		 387 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.83 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.09 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.85 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.42 
 
 		 387 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.59 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.84 
 
 		 398 aa  463  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>