More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3878 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.48 
 
 
386 aa  773    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  97.93 
 
 
386 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
386 aa  775    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.45 
 
 
386 aa  764    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.74 
 
 
386 aa  773    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
386 aa  775    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
386 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.22 
 
 
386 aa  771    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.74 
 
 
386 aa  773    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  89.09 
 
 
386 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
386 aa  775    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  87.27 
 
 
386 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80 
 
 
388 aa  624  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.44 
 
 
388 aa  618  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.44 
 
 
388 aa  618  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  72.47 
 
 
384 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  68.41 
 
 
388 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  67.01 
 
 
389 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.31 
 
 
389 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.57 
 
 
389 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.71 
 
 
390 aa  511  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.49 
 
 
392 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.49 
 
 
388 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  66.23 
 
 
386 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  64.3 
 
 
399 aa  501  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.1 
 
 
389 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.49 
 
 
388 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.75 
 
 
392 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.6 
 
 
392 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.68 
 
 
391 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.86 
 
 
391 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  65.71 
 
 
387 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.38 
 
 
392 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.72 
 
 
388 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.84 
 
 
390 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.91 
 
 
389 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.29 
 
 
403 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.97 
 
 
387 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.72 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.98 
 
 
388 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.38 
 
 
388 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.18 
 
 
388 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.38 
 
 
389 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.82 
 
 
390 aa  487  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.56 
 
 
392 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.11 
 
 
388 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.44 
 
 
398 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.27 
 
 
397 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.45 
 
 
386 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
389 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.01 
 
 
397 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.28 
 
 
397 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.45 
 
 
386 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.01 
 
 
397 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.77 
 
 
397 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.52 
 
 
397 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.9 
 
 
386 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.04 
 
 
388 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.24 
 
 
388 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.76 
 
 
400 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.94 
 
 
386 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.51 
 
 
388 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.68 
 
 
407 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 
386 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.51 
 
 
399 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.38 
 
 
386 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.42 
 
 
386 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60 
 
 
410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.76 
 
 
398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.75 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.16 
 
 
386 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.77 
 
 
398 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3849  succinyl-CoA synthetase beta chain  99.13 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.19396e-62 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.64 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.64 
 
 
389 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.2 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.83 
 
 
389 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.38 
 
 
386 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.97 
 
 
398 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.1 
 
 
388 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.1 
 
 
388 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.1 
 
 
388 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.83 
 
 
388 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.03 
 
 
399 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.76 
 
 
399 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60 
 
 
398 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.6 
 
 
386 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.75 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>