More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2678 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.45 
 
 
388 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  86.6 
 
 
388 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  86.34 
 
 
388 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.74 
 
 
388 aa  777    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
388 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  86.34 
 
 
389 aa  634    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.71 
 
 
388 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.78 
 
 
388 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  91.22 
 
 
389 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  90.72 
 
 
389 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  89.89 
 
 
389 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
388 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  86.6 
 
 
388 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  99.74 
 
 
388 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
388 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  92.27 
 
 
388 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  85.05 
 
 
388 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.14 
 
 
389 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.6 
 
 
386 aa  584  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.19 
 
 
389 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  75.52 
 
 
386 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.22 
 
 
386 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  75.52 
 
 
386 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.78 
 
 
386 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.78 
 
 
386 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.04 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.67 
 
 
388 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  76.56 
 
 
388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.04 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.52 
 
 
386 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  75.26 
 
 
386 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.74 
 
 
386 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2730  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  71.76 
 
 
388 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.23 
 
 
386 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.23 
 
 
386 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  67.53 
 
 
389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.27 
 
 
386 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.01 
 
 
386 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.75 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.75 
 
 
386 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.75 
 
 
386 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.63 
 
 
398 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.24 
 
 
389 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  62.76 
 
 
388 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.57 
 
 
388 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.14 
 
 
384 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.26 
 
 
388 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.9 
 
 
399 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.26 
 
 
388 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.9 
 
 
403 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.5 
 
 
426 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.68 
 
 
397 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.68 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.93 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 
397 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 
397 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.92 
 
 
389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.6 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.93 
 
 
398 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 
391 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.74 
 
 
399 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.19 
 
 
399 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.87 
 
 
398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.43 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.43 
 
 
398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.07 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.76 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.43 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.87 
 
 
398 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.41 
 
 
392 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.38 
 
 
390 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.11 
 
 
388 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.42 
 
 
398 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.82 
 
 
399 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.11 
 
 
388 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.42 
 
 
397 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 
399 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.67 
 
 
397 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.11 
 
 
397 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.61 
 
 
398 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.36 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.85 
 
 
398 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.35 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  58.29 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.41 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.41 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.93 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.92 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.11 
 
 
410 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>