More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0425 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  100 
 
 		 387 aa  773    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 387 aa  773    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.48 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.75 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.37 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  60.9 
 
 		 386 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.45 
 
 		 386 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  56.59 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.66 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.45 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  55.04 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.41 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  56.59 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.41 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.43 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.26 
 
 		 388 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.15 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.35 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.07 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.43 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.35 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  55.3 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  55.7 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  55.56 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  53.11 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.15 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 		 387 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.62 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.41 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  55.3 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.23 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.56 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.8 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.01 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.22 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.48 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.48 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.99 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.89 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  55.06 
 
 		 392 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.43 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.48 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.48 
 
 		 386 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  51.68 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.96 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2103  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2181  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1839  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.75 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00288074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2341  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.04 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.56 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.69 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.78 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1838  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.062455  normal  0.042007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.05 
 
 		 410 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1790  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.58 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.69 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.7 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.14 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2626  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00132784  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.26 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.57 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.69 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.75 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.508619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>