More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1374 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 390 aa  783    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  62.92 
 
 		 386 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.91 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.91 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.36 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.36 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.96 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.52 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.7 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.66 
 
 		 388 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.48 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.71 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  56.62 
 
 		 388 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.19 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.62 
 
 		 388 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.9 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.87 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.28 
 
 		 388 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.62 
 
 		 388 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.61 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.44 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.7 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.22 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.17 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004110  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] beta chain  57.4 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.4 
 
 		 388 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.44 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.85 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.7 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.92 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.96 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.66 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.96 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.45 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.59 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2103  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.7 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01357  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.66 
 
 		 388 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.44 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.18 
 
 		 388 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1839  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.34 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.34 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.59 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.45 
 
 		 386 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3757  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.62 
 
 		 388 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  58.29 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.36 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.02 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.69 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1838  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.062455  normal  0.042007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2626  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00132784  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.85 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.99 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.19 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.76 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2181  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.88 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1790  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.88 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00288074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.02 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.88 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.55 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0848  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.02 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2341  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.62 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.91 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.88 
 
 		 388 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.84 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.24 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.32 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.32 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.93 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2812  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.84 
 
 		 388 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  55.32 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.27 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.65 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0504146  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.83 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>