More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2714 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  87.11 
 
 
384 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  85.04 
 
 
385 aa  635    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
382 aa  755    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.74 
 
 
381 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.37 
 
 
381 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
379 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.28 
 
 
384 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
379 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.68 
 
 
378 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.56 
 
 
387 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  49.48 
 
 
383 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.8 
 
 
378 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.53 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.63 
 
 
386 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.72 
 
 
389 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.01 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.75 
 
 
386 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.75 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.49 
 
 
386 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.83 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.43 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.96 
 
 
386 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.41 
 
 
382 aa  319  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.6 
 
 
384 aa  318  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.19 
 
 
391 aa  315  6e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.3 
 
 
382 aa  315  9e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.45 
 
 
388 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.66 
 
 
400 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.86 
 
 
382 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.03 
 
 
382 aa  311  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.12 
 
 
382 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  44.94 
 
 
392 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.07 
 
 
389 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.6 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.4 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  45.19 
 
 
390 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.84 
 
 
393 aa  308  8e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  44.07 
 
 
392 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  44.94 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  44.94 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.34 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  44.33 
 
 
392 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.55 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.53 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.07 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.07 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.07 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.01 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.43 
 
 
388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.52 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.9 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.55 
 
 
387 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.25 
 
 
386 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
385 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.25 
 
 
386 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.31 
 
 
392 aa  299  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.78 
 
 
385 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.04 
 
 
387 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.75 
 
 
388 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.99 
 
 
400 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.17 
 
 
388 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.81 
 
 
395 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
388 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.59 
 
 
409 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.81 
 
 
388 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.51 
 
 
388 aa  296  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.81 
 
 
388 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.4 
 
 
395 aa  296  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.86 
 
 
394 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.7 
 
 
387 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.42 
 
 
388 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.55 
 
 
410 aa  295  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.51 
 
 
392 aa  294  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.7 
 
 
387 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.03 
 
 
411 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.75 
 
 
388 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.22 
 
 
385 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  42.46 
 
 
389 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.83 
 
 
389 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.14 
 
 
396 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.03 
 
 
387 aa  292  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.76 
 
 
387 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  43.21 
 
 
389 aa  292  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.6 
 
 
392 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.24 
 
 
392 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.03 
 
 
393 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.82 
 
 
389 aa  291  9e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.08 
 
 
387 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  42.71 
 
 
395 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.65 
 
 
390 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  41.8 
 
 
387 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.8 
 
 
387 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.7 
 
 
391 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.24 
 
 
387 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.4 
 
 
361 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>