More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
394 aa  783    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  78.52 
 
 
390 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  76.79 
 
 
400 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.73 
 
 
389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.73 
 
 
389 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.91 
 
 
388 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  75.13 
 
 
393 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.53 
 
 
411 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.42 
 
 
389 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.67 
 
 
389 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.89 
 
 
395 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.55 
 
 
389 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.11 
 
 
392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.43 
 
 
387 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.67 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.67 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.67 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  69.9 
 
 
387 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.92 
 
 
387 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.34 
 
 
389 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  67.43 
 
 
387 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.65 
 
 
387 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.75 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.29 
 
 
387 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.28 
 
 
396 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.16 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.75 
 
 
388 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.19 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.18 
 
 
393 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.38 
 
 
392 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.66 
 
 
410 aa  463  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3590  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.75 
 
 
386 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  62.5 
 
 
393 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.86 
 
 
392 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.26 
 
 
395 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.24 
 
 
393 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.01 
 
 
392 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.9 
 
 
384 aa  364  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.53 
 
 
382 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  50.9 
 
 
383 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0456  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.65 
 
 
400 aa  338  7e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00206405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.23 
 
 
378 aa  331  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.95 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.7 
 
 
379 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.45 
 
 
378 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.85 
 
 
387 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.43 
 
 
391 aa  322  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.98 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.58 
 
 
382 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.06 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.48 
 
 
381 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.44 
 
 
379 aa  311  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.03 
 
 
389 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
392 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43 
 
 
392 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.71 
 
 
382 aa  311  2e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.47 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.72 
 
 
382 aa  310  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.96 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.35 
 
 
393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.07 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.89 
 
 
391 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.59 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.17 
 
 
385 aa  306  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.32 
 
 
384 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.23 
 
 
392 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
390 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.13 
 
 
388 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  41.67 
 
 
396 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43 
 
 
391 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.99 
 
 
390 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.64 
 
 
386 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
386 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.99 
 
 
395 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.64 
 
 
386 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.73 
 
 
390 aa  295  7e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.81 
 
 
386 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.21 
 
 
385 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.48 
 
 
381 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
386 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.11 
 
 
386 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
388 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
388 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
388 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
388 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
388 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  41.46 
 
 
395 aa  292  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.15 
 
 
387 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.46 
 
 
385 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.54 
 
 
383 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42 
 
 
388 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.75 
 
 
389 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.65 
 
 
382 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.65 
 
 
387 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.55 
 
 
387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.6 
 
 
386 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.71 
 
 
388 aa  289  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.6 
 
 
386 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.55 
 
 
387 aa  289  8e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
388 aa  288  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>