More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1529 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  84.51 
 
 
382 aa  661    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  82.06 
 
 
379 aa  642    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  83.2 
 
 
382 aa  660    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
382 aa  764    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
379 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
379 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.56 
 
 
382 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.08 
 
 
377 aa  358  9.999999999999999e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.4 
 
 
387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.63 
 
 
378 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.44 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.57 
 
 
383 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.97 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.3 
 
 
388 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.1 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.2 
 
 
389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.02 
 
 
386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.53 
 
 
386 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.39 
 
 
388 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.44 
 
 
388 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.53 
 
 
386 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.6 
 
 
388 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.65 
 
 
389 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.72 
 
 
382 aa  315  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.01 
 
 
389 aa  315  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.78 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.53 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.42 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.53 
 
 
393 aa  312  6.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.86 
 
 
391 aa  311  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.53 
 
 
385 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.89 
 
 
386 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.7 
 
 
398 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.08 
 
 
400 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.77 
 
 
390 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.25 
 
 
389 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.14 
 
 
397 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.77 
 
 
392 aa  309  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.97 
 
 
384 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.31 
 
 
381 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.97 
 
 
385 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.38 
 
 
387 aa  308  9e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.48 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.01 
 
 
392 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  41.4 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.74 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.49 
 
 
388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.9 
 
 
387 aa  305  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.14 
 
 
397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.37 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.2 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.47 
 
 
407 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.92 
 
 
387 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.32 
 
 
411 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.89 
 
 
388 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.3 
 
 
383 aa  301  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.9 
 
 
397 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.9 
 
 
397 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.12 
 
 
389 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  43.29 
 
 
395 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.33 
 
 
382 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.39 
 
 
388 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.75 
 
 
395 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.39 
 
 
388 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.87 
 
 
387 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.03 
 
 
381 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.81 
 
 
390 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.74 
 
 
393 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.18 
 
 
382 aa  299  7e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.02 
 
 
392 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.11 
 
 
391 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.12 
 
 
410 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.03 
 
 
394 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.79 
 
 
388 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.54 
 
 
389 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.02 
 
 
387 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.51 
 
 
390 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.59 
 
 
389 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.54 
 
 
403 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1716  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
394 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.61 
 
 
393 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.31 
 
 
388 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.25 
 
 
397 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.3 
 
 
382 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.1 
 
 
387 aa  296  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.51 
 
 
387 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.05 
 
 
392 aa  296  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3398  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41 
 
 
404 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.694638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.84 
 
 
397 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.39 
 
 
389 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.05 
 
 
388 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.65 
 
 
388 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.42 
 
 
388 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  44.09 
 
 
393 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.92 
 
 
388 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.47 
 
 
375 aa  292  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.58 
 
 
386 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>