More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3724 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
392 aa  769    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.58 
 
 
388 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.32 
 
 
388 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.32 
 
 
388 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.14 
 
 
387 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  62.02 
 
 
388 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.59 
 
 
386 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.21 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.55 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.53 
 
 
399 aa  455  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.61 
 
 
410 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.31 
 
 
384 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.4 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.4 
 
 
386 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.25 
 
 
407 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.14 
 
 
386 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.87 
 
 
386 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.14 
 
 
386 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.14 
 
 
386 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.14 
 
 
386 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.87 
 
 
386 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.08 
 
 
397 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.09 
 
 
403 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.14 
 
 
386 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.7 
 
 
389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.61 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.51 
 
 
392 aa  441  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.77 
 
 
399 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.55 
 
 
392 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.67 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.15 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.05 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3398  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.25 
 
 
404 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.694638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.93 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.68 
 
 
399 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.55 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.64 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.64 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.55 
 
 
391 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.22 
 
 
386 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.31 
 
 
399 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.93 
 
 
410 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.21 
 
 
390 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.42 
 
 
398 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.03 
 
 
391 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.73 
 
 
390 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.54 
 
 
398 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
397 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.05 
 
 
397 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.31 
 
 
398 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.8 
 
 
397 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.54 
 
 
399 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.79 
 
 
397 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.66 
 
 
399 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.11 
 
 
387 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.33 
 
 
388 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.38 
 
 
389 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
397 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  58.44 
 
 
387 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.67 
 
 
398 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.33 
 
 
388 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.67 
 
 
398 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.11 
 
 
389 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.59 
 
 
383 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
397 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
397 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.79 
 
 
426 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3396  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
397 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.67 
 
 
398 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
398 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.85 
 
 
392 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.85 
 
 
392 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.81 
 
 
389 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
398 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.75 
 
 
391 aa  418  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4127  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.22 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.25 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.55 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.22 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  54.95 
 
 
392 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.25 
 
 
386 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.04 
 
 
398 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  56.52 
 
 
389 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.94 
 
 
387 aa  412  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.58 
 
 
389 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.04 
 
 
398 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  54.43 
 
 
390 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 
387 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 
387 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.55 
 
 
399 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.24 
 
 
393 aa  408  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  54.43 
 
 
390 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  54.66 
 
 
390 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 
389 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.7 
 
 
386 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  54.55 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.38 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  53.37 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>