More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4569 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
378 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.82 
 
 
379 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.09 
 
 
379 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.5 
 
 
382 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.14 
 
 
382 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.45 
 
 
391 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
387 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
392 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  48.84 
 
 
395 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.36 
 
 
386 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.05 
 
 
390 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 
390 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
390 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
392 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.17 
 
 
385 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.74 
 
 
384 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 
387 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
387 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.94 
 
 
388 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  47.94 
 
 
389 aa  358  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.94 
 
 
388 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
387 aa  358  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.85 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.66 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.68 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.13 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.33 
 
 
386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.68 
 
 
384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.92 
 
 
386 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
388 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.31 
 
 
391 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
387 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.66 
 
 
386 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.42 
 
 
383 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
386 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
409 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.39 
 
 
389 aa  352  8.999999999999999e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
386 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
386 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.99 
 
 
387 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.49 
 
 
392 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.91 
 
 
387 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.42 
 
 
388 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.32 
 
 
386 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.23 
 
 
390 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.42 
 
 
388 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.65 
 
 
388 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.36 
 
 
389 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.01 
 
 
392 aa  349  5e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.16 
 
 
388 aa  348  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.55 
 
 
386 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.39 
 
 
389 aa  348  1e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.21 
 
 
389 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  46.91 
 
 
388 aa  347  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.61 
 
 
382 aa  348  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.63 
 
 
382 aa  347  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  47.26 
 
 
396 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
388 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
388 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
388 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.67 
 
 
389 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.71 
 
 
389 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  50.95 
 
 
386 aa  345  8e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  44.72 
 
 
399 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  47.4 
 
 
392 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.74 
 
 
395 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.95 
 
 
381 aa  344  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  47.03 
 
 
390 aa  344  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  45.99 
 
 
388 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.99 
 
 
388 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48 
 
 
378 aa  344  2e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  45.74 
 
 
392 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.09 
 
 
391 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.29 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  45.99 
 
 
392 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
388 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.49 
 
 
391 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.84 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.84 
 
 
397 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  46.88 
 
 
390 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  46.88 
 
 
390 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.29 
 
 
388 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.77 
 
 
391 aa  340  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.34 
 
 
398 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.33 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.32 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.45 
 
 
389 aa  339  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.640254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.48 
 
 
388 aa  339  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.33 
 
 
387 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  46.05 
 
 
392 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.33 
 
 
397 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.87 
 
 
382 aa  339  5e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
388 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.14 
 
 
379 aa  338  7e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.1 
 
 
388 aa  338  9e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>