More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4424 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
387 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.33 
 
 
389 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 
411 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  74.23 
 
 
390 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.4 
 
 
392 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.21 
 
 
389 aa  551  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  73.01 
 
 
400 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.82 
 
 
392 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  73.82 
 
 
393 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.09 
 
 
389 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.69 
 
 
387 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.09 
 
 
389 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.77 
 
 
392 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.65 
 
 
387 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.87 
 
 
389 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.43 
 
 
387 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.43 
 
 
387 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.43 
 
 
387 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.13 
 
 
388 aa  538  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.73 
 
 
400 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.03 
 
 
387 aa  532  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.34 
 
 
388 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  69.69 
 
 
387 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  69.61 
 
 
387 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.62 
 
 
389 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.13 
 
 
392 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.9 
 
 
394 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.22 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.34 
 
 
388 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.58 
 
 
410 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.45 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66.84 
 
 
393 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.64 
 
 
392 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  65.44 
 
 
393 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.23 
 
 
393 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.54 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3590  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.31 
 
 
386 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 
384 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0456  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.87 
 
 
400 aa  353  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00206405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.9 
 
 
387 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  49.09 
 
 
383 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.61 
 
 
382 aa  320  3e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.51 
 
 
378 aa  318  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.37 
 
 
386 aa  315  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.54 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.11 
 
 
386 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.25 
 
 
378 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.3 
 
 
385 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.35 
 
 
379 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.09 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.3 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.09 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.23 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.23 
 
 
382 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.12 
 
 
386 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.7 
 
 
379 aa  301  2e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.73 
 
 
382 aa  301  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.12 
 
 
387 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.19 
 
 
382 aa  299  5e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.69 
 
 
384 aa  299  6e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.19 
 
 
385 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.57 
 
 
389 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
386 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
386 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.93 
 
 
385 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
386 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.22 
 
 
382 aa  293  3e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  43 
 
 
389 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.92 
 
 
391 aa  293  5e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  41.91 
 
 
396 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.71 
 
 
389 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.34 
 
 
384 aa  290  4e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  42.97 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.98 
 
 
388 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  43.19 
 
 
392 aa  289  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  42.71 
 
 
390 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  42.71 
 
 
390 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  41.69 
 
 
392 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.67 
 
 
381 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.59 
 
 
388 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.46 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.9 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  41.69 
 
 
392 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  41.42 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.24 
 
 
388 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  42.28 
 
 
392 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  42.28 
 
 
395 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.87 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.61 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.35 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.19 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.19 
 
 
385 aa  282  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.72 
 
 
387 aa  281  9e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>