More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1740 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  100 
 
 
389 aa  793    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  59.79 
 
 
388 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.05 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.54 
 
 
386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  60.42 
 
 
389 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.02 
 
 
389 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  57.58 
 
 
392 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  57.58 
 
 
392 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.66 
 
 
386 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  57.98 
 
 
399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  57.07 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  57.07 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  56.81 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  56.77 
 
 
392 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  57.18 
 
 
392 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.89 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.89 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.15 
 
 
388 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.64 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  54.69 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.11 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  55.47 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.64 
 
 
388 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.39 
 
 
397 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.99 
 
 
386 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.99 
 
 
386 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.25 
 
 
386 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.1 
 
 
389 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.03 
 
 
403 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.64 
 
 
397 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.77 
 
 
400 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.85 
 
 
388 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.47 
 
 
386 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.85 
 
 
388 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.28 
 
 
410 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.3 
 
 
387 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.27 
 
 
399 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.13 
 
 
398 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.91 
 
 
388 aa  421  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.52 
 
 
399 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.14 
 
 
397 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.7 
 
 
386 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.19 
 
 
389 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
390 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  55.3 
 
 
386 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.7 
 
 
388 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.7 
 
 
386 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.56 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.9 
 
 
383 aa  416  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.56 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.96 
 
 
392 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.73 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
391 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.93 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.07 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.45 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.67 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.39 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.24 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.56 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.19 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.38 
 
 
398 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.88 
 
 
398 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.19 
 
 
386 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.14 
 
 
389 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.61 
 
 
388 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.38 
 
 
398 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.44 
 
 
386 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.88 
 
 
398 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.52 
 
 
399 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.52 
 
 
426 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 
388 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.63 
 
 
391 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.52 
 
 
398 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.38 
 
 
398 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.88 
 
 
389 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.08 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.12 
 
 
389 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.35 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.35 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.17 
 
 
392 aa  409  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.08 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.88 
 
 
397 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.97 
 
 
387 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.63 
 
 
398 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.16 
 
 
398 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.35 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.35 
 
 
388 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.89 
 
 
392 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.08 
 
 
388 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>