More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1265 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
400 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.54 
 
 
387 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.54 
 
 
387 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.54 
 
 
387 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.03 
 
 
387 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  70.03 
 
 
387 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.51 
 
 
387 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.07 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.99 
 
 
387 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  70.1 
 
 
389 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.57 
 
 
387 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  72.53 
 
 
389 aa  524  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  73.07 
 
 
387 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.13 
 
 
389 aa  510  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  68.64 
 
 
390 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.13 
 
 
389 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.43 
 
 
411 aa  507  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.69 
 
 
392 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  67.27 
 
 
400 aa  504  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  68.49 
 
 
393 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68.53 
 
 
388 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.4 
 
 
392 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.14 
 
 
392 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.63 
 
 
388 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.2 
 
 
389 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.34 
 
 
392 aa  481  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  68 
 
 
388 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  63.19 
 
 
396 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.18 
 
 
393 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.92 
 
 
410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.4 
 
 
395 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.71 
 
 
394 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3590  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.8 
 
 
386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  61.08 
 
 
392 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  62.37 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.42 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.1 
 
 
395 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.57 
 
 
384 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0456  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.21 
 
 
400 aa  350  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00206405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.04 
 
 
382 aa  347  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.43 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.92 
 
 
386 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.99 
 
 
384 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.15 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.9 
 
 
386 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.9 
 
 
386 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.64 
 
 
386 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.44 
 
 
391 aa  322  7e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.45 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.13 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.58 
 
 
388 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  47.04 
 
 
383 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.28 
 
 
378 aa  315  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.3 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.68 
 
 
389 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.42 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.43 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.77 
 
 
382 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.21 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
388 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.07 
 
 
388 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.22 
 
 
378 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.93 
 
 
381 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.62 
 
 
382 aa  301  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.75 
 
 
389 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.93 
 
 
382 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  42.67 
 
 
388 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.89 
 
 
387 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.81 
 
 
379 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.73 
 
 
386 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  42.78 
 
 
389 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.38 
 
 
387 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.78 
 
 
379 aa  293  4e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.49 
 
 
387 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.24 
 
 
382 aa  290  3e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.5 
 
 
382 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  43.48 
 
 
395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.24 
 
 
387 aa  289  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.39 
 
 
389 aa  288  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.27 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.26 
 
 
384 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.19 
 
 
388 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.86 
 
 
387 aa  285  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.37 
 
 
392 aa  285  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  43.19 
 
 
385 aa  285  8e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.01 
 
 
390 aa  285  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.92 
 
 
388 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  42.03 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  41.03 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.17 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>