More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0558 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.45 
 
 
387 aa  766    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.19 
 
 
387 aa  761    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
387 aa  778    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  64.47 
 
 
391 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.96 
 
 
391 aa  487  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1137  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.03 
 
 
387 aa  475  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.35 
 
 
385 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.63 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.56 
 
 
386 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.3 
 
 
386 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.56 
 
 
386 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.18 
 
 
386 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.56 
 
 
386 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
388 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 
388 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 
386 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 
388 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.78 
 
 
386 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.02 
 
 
397 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.76 
 
 
397 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.51 
 
 
397 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.02 
 
 
397 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.75 
 
 
390 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.7 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.26 
 
 
397 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.27 
 
 
398 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.26 
 
 
397 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.56 
 
 
388 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.51 
 
 
397 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.21 
 
 
383 aa  409  1e-113  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.82 
 
 
399 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.05 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.33 
 
 
398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.45 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.85 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.27 
 
 
398 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.85 
 
 
391 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1882  succinyl-CoA synthetase beta chain (SCS-alpha)(vegetative protein 63) (VEG63)  53.28 
 
 
390 aa  401  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.84 
 
 
392 aa  402  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.66 
 
 
395 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.76 
 
 
397 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.54 
 
 
398 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.11 
 
 
392 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.27 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  51.74 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.3 
 
 
398 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.35 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.25 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.77 
 
 
398 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.02 
 
 
398 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.08 
 
 
389 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.16 
 
 
386 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.26 
 
 
398 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.16 
 
 
386 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  51.79 
 
 
399 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.99 
 
 
386 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.18 
 
 
426 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.25 
 
 
410 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  50.4 
 
 
392 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.85 
 
 
399 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.51 
 
 
398 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  49.35 
 
 
392 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.02 
 
 
398 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.54 
 
 
399 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.16 
 
 
388 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  49.35 
 
 
390 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.63 
 
 
410 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.16 
 
 
386 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.49 
 
 
399 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  48.18 
 
 
395 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  49.1 
 
 
392 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.38 
 
 
403 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.45 
 
 
388 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.45 
 
 
388 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.16 
 
 
388 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  51.47 
 
 
389 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.62 
 
 
388 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  50.13 
 
 
390 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  50.13 
 
 
390 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.6 
 
 
389 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.42 
 
 
387 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.59 
 
 
387 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.39 
 
 
403 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.21 
 
 
389 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.18 
 
 
388 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.99 
 
 
386 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.99 
 
 
386 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
386 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.63 
 
 
398 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.53 
 
 
389 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.61 
 
 
407 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>