More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0981 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2736  succinyl-CoA synthetase subunit beta  82.72 
 
 
407 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.217876  normal  0.563324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
405 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  73.58 
 
 
403 aa  595  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6602  succinyl-CoA synthetase subunit beta  71.53 
 
 
404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3018  succinyl-CoA synthetase subunit beta  69.9 
 
 
396 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.632407  hitchhiker  0.0091052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.33 
 
 
397 aa  535  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08536  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  66 
 
 
397 aa  528  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2162  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.5 
 
 
397 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  60.79 
 
 
395 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  60.7 
 
 
390 aa  478  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.45 
 
 
390 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.66 
 
 
391 aa  473  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.66 
 
 
392 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.91 
 
 
392 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.06 
 
 
392 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.71 
 
 
391 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.21 
 
 
386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.97 
 
 
386 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.97 
 
 
386 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.22 
 
 
386 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.22 
 
 
386 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
386 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.98 
 
 
386 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.03 
 
 
391 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.08 
 
 
389 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.66 
 
 
388 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  54.43 
 
 
399 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.93 
 
 
403 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.11 
 
 
388 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.11 
 
 
388 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.11 
 
 
388 aa  408  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.07 
 
 
398 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5147  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.15 
 
 
390 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.710728  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3875  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.47 
 
 
392 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2406  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.52 
 
 
394 aa  408  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.502778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.97 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.23 
 
 
384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.61 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.46 
 
 
397 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.46 
 
 
397 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4693  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.5 
 
 
407 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0453308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.72 
 
 
388 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.46 
 
 
397 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.72 
 
 
388 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.62 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.7 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.11 
 
 
398 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.99 
 
 
397 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.97 
 
 
397 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.74 
 
 
389 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  50.99 
 
 
387 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.23 
 
 
397 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.62 
 
 
397 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.74 
 
 
389 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.24 
 
 
388 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.24 
 
 
388 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1926  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.37 
 
 
398 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  50.87 
 
 
392 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1855  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.37 
 
 
398 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.06 
 
 
387 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.5 
 
 
392 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.22 
 
 
399 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.24 
 
 
387 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.5 
 
 
392 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.99 
 
 
388 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.97 
 
 
398 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4233  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.25 
 
 
393 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.510138  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0074  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.44 
 
 
388 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.698704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.74 
 
 
386 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.91 
 
 
393 aa  388  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000861995  hitchhiker  0.0000000000000037897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.73 
 
 
426 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.23 
 
 
398 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.12 
 
 
399 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.74 
 
 
386 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  50.12 
 
 
392 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.36 
 
 
386 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.48 
 
 
398 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  50.25 
 
 
386 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.86 
 
 
391 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.13 
 
 
389 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.76 
 
 
389 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.48 
 
 
399 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.62 
 
 
386 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.63 
 
 
390 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.75 
 
 
383 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.4 
 
 
388 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
389 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.23 
 
 
399 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.38 
 
 
382 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.11 
 
 
398 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.16 
 
 
388 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  50.5 
 
 
390 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  50.13 
 
 
392 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.65 
 
 
388 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.37 
 
 
398 aa  381  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>