More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2040 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
386 aa  767    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  61.3 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.95 
 
 
397 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.95 
 
 
397 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.95 
 
 
397 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.44 
 
 
397 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.03 
 
 
389 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.26 
 
 
401 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.62 
 
 
391 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.41 
 
 
397 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.16 
 
 
397 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.34 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.68 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.66 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.03 
 
 
388 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.43 
 
 
387 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.39 
 
 
388 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  56.15 
 
 
389 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.24 
 
 
390 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.39 
 
 
398 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 
410 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 
398 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.88 
 
 
388 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.73 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.89 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.89 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3605  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.66 
 
 
410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194047  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  52.86 
 
 
388 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.86 
 
 
388 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.9 
 
 
398 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.55 
 
 
387 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
390 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
399 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.91 
 
 
386 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 
398 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.66 
 
 
398 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
390 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.17 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
388 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.89 
 
 
400 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.81 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.55 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.08 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  51.69 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.16 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  50.91 
 
 
392 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
386 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  51.39 
 
 
399 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  51.17 
 
 
392 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.39 
 
 
399 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.48 
 
 
386 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.82 
 
 
389 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  50.91 
 
 
390 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  50.91 
 
 
390 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.17 
 
 
409 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.9 
 
 
403 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  50.52 
 
 
392 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.96 
 
 
386 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  56.53 
 
 
386 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.7 
 
 
386 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.27 
 
 
398 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.12 
 
 
388 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.38 
 
 
399 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.83 
 
 
393 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000861995  hitchhiker  0.0000000000000037897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.7 
 
 
386 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.57 
 
 
388 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.89 
 
 
397 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.57 
 
 
388 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.72 
 
 
391 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.81 
 
 
392 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3164  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 
389 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.55 
 
 
387 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 
388 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
390 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.81 
 
 
392 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
389 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
387 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.91 
 
 
388 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.38 
 
 
426 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.79 
 
 
384 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.03 
 
 
388 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 
388 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.03 
 
 
388 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0805  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.7 
 
 
386 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.623629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.34 
 
 
388 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.03 
 
 
388 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.91 
 
 
399 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>