More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0097 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0097  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  100 
 
 
393 aa  798    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.07 
 
 
388 aa  524  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.07 
 
 
388 aa  524  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.07 
 
 
388 aa  524  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.07 
 
 
388 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.55 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  66.32 
 
 
388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.78 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.3 
 
 
388 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.78 
 
 
388 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.13 
 
 
388 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1790  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  58.87 
 
 
388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.13 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2181  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.13 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1838  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.062455  normal  0.042007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00288074  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2626  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00132784  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2812  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004110  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] beta chain  58.87 
 
 
388 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1839  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.1 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01357  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.73 
 
 
389 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2341  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.13 
 
 
388 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.35 
 
 
388 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.13 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0848  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.9 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
388 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0504146  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.9 
 
 
388 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3757  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
409 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.07 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2103  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.61 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32957  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.11 
 
 
389 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.56 
 
 
388 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.87 
 
 
389 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.44 
 
 
390 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.44 
 
 
390 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.66 
 
 
387 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 
387 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.87 
 
 
391 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.76 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.1 
 
 
386 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
389 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.84 
 
 
388 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.39 
 
 
387 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.45 
 
 
386 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  47.57 
 
 
392 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  47.31 
 
 
392 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  48.4 
 
 
387 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.99 
 
 
397 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.4 
 
 
387 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.19 
 
 
386 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3164  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.61 
 
 
389 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768074  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.35 
 
 
389 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.640254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
397 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.94 
 
 
391 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.73 
 
 
389 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.74 
 
 
397 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.3 
 
 
391 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
397 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  47 
 
 
392 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0967  succinyl-CoA synthase, beta subunit  50.67 
 
 
386 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  45.9 
 
 
390 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
397 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  46.15 
 
 
390 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.61 
 
 
390 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.67 
 
 
384 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  46.15 
 
 
390 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 
397 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.51 
 
 
389 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>