More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004110 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004110  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] beta chain  100 
 
 		 388 aa  786    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01357  succinyl-CoA synthetase subunit beta  98.45 
 
 		 388 aa  780    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  94.07 
 
 		 388 aa  726    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0848  succinyl-CoA synthetase subunit beta  90.67 
 
 		 388 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2221  succinyl-CoA synthetase subunit beta  83.51 
 
 		 388 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0353826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1839  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.96 
 
 		 388 aa  631  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2812  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80.67 
 
 		 388 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  81.7 
 
 		 388 aa  624  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.61 
 
 		 388 aa  624  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  77.06 
 
 		 388 aa  624  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.96 
 
 		 389 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1790  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80.93 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2267  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  618  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.44 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.44 
 
 		 388 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00288074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1429  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80.93 
 
 		 388 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2626  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00132784  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1838  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.062455  normal  0.042007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2506  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2513  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.955755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  80.93 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1712  succinyl-CoA synthetase subunit beta  81.19 
 
 		 388 aa  615  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0807295  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  82.47 
 
 		 388 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0504146  normal  0.508057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2181  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.9 
 
 		 388 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2341  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.64 
 
 		 388 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.03 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  76.03 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.03 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.58 
 
 		 388 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.32 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  598  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.32 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3098  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.12 
 
 		 388 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.32 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  78.87 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  79.12 
 
 		 388 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.801133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2908  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.816309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0740  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0775  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0820  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00676  hypothetical protein  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0754  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2928  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.523722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610511  normal  0.0166636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0894  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0771  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0797  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0208379  normal  0.0728159 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0832  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00412785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0861  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.06 
 
 		 388 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0229067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0647  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.29 
 
 		 388 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1228  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3757  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.8 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  77.84 
 
 		 388 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.03 
 
 		 409 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1157  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  76.55 
 
 		 388 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29740  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  74.61 
 
 		 389 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2103  succinyl-CoA synthetase subunit beta  76.29 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.97 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  67.71 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.95 
 
 		 389 aa  521  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1557  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.75 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0597  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.97 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0269  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.69 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0097  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.87 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.21 
 
 		 391 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0105  succinyl-CoA synthetase subunit beta  63.92 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0114  succinyl-CoA synthetase subunit beta  64.18 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  58.59 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  55.96 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.29 
 
 		 387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.76 
 
 		 386 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  57.18 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.97 
 
 		 386 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1374  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  57.4 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.31 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  58.81 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.57 
 
 		 386 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.31 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.31 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.31 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.29 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.31 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.78 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.05 
 
 		 386 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.04 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.75 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.04 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.06 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.9 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>