231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1326 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  694    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  60.7 
 
 
368 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  41.04 
 
 
339 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  23.19 
 
 
336 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  23.87 
 
 
336 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  22.05 
 
 
336 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.87 
 
 
321 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  25.07 
 
 
393 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  26.69 
 
 
334 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  24.31 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  26.05 
 
 
334 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  26.53 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  21.75 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  25.68 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.25 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  20.75 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.26 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  23.65 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  20.35 
 
 
355 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.65 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  22.96 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  26.96 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  26.89 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  23.6 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.03 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.03 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.03 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.03 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.03 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  25.55 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  25.55 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  25.91 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  25.55 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  25.55 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  25.55 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  22.29 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  23.05 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  23.53 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  24.11 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  24.11 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  25.55 
 
 
353 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.61 
 
 
355 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  21.43 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  23.53 
 
 
363 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.51 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.31 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.91 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  28.27 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  18.99 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3452  hypothetical protein  20.49 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  20.12 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  22.8 
 
 
452 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  18.99 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  20.12 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  21.22 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.84 
 
 
346 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  24.39 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  26.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  25.55 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  26.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  20.69 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  22.03 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  24.28 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  28.37 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  25.55 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  25.55 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  26.11 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  27.87 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.38 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  22.71 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  24.6 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.61 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  21.74 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  20.32 
 
 
349 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  26.72 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  30.36 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  27.75 
 
 
366 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  19.58 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  22.25 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  19.58 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  23.53 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  19.58 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  27.75 
 
 
366 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>