More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0387 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  82.25 
 
 
231 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  50.67 
 
 
226 aa  227  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 
241 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
200 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
243 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
214 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  37.95 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
240 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  31.75 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  34.12 
 
 
191 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 
294 aa  88.6  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.36 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  32.31 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  31.8 
 
 
281 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
282 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 
287 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  28.7 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  30.34 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  30.53 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  30.84 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  31.53 
 
 
285 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  31.62 
 
 
285 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 
285 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 
192 aa  82  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  33.83 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
273 aa  78.2  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
306 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.63 
 
 
318 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  33.74 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  32 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  42.24 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  32.91 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  27.7 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  34.88 
 
 
363 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  26.42 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  32.9 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.35 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  30.27 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.05 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  24.39 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  26.42 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  30.47 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  32.23 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.68 
 
 
201 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.94 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.16 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  26.61 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.63 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>