177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1844 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 161 aa  308  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  39.35 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  38.35 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.45 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  42.4 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.97 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.28 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.63 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  36.51 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  32.85 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  36.51 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.29 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.22 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  33.9 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  29.63 
 
 		 184 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  27.54 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  30.37 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.66 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.97 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  28.99 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  29.56 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.2 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  33.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  33.62 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  27.52 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  25.64 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  30.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  26.76 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  26.76 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.38 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  35.58 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  38.97 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.29 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  27.73 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.74 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  30.4 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  31.78 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  27.5 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  30.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.45 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.05 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  31.03 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  27.35 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  30.61 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.3 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.89 
 
 		 1053 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.17 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  25.5 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  28.83 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  25.97 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  24.03 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.32 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  28.97 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  28.69 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  33.76 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.43 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  25.66 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  25.66 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  28.06 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.69 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  31.43 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.41 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.88 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  25.36 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  26.25 
 
 		 180 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  28.83 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.1 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  27.12 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  27.12 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  27.12 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  27.12 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  26.09 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.12 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  32.98 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>