More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3492 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  45.42 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  48.18 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  38.58 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  34.32 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  31.82 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  31.28 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  30.1 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  30.7 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.73 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  30.56 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  31.77 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  24.15 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.5 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  24.15 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  24.15 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  30.46 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  30.46 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  26.38 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  30.18 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.78 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  25.97 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.51 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  24.59 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.65 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  32.12 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.11 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  25.11 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>