More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3149 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3149  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0282952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  48.57 
 
 		 346 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 386 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 335 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  40.52 
 
 		 348 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 357 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3689  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 331 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 364 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 343 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 358 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 348 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 358 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 338 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 340 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 359 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  41.28 
 
 		 346 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 334 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 334 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 353 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 334 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  39.6 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 359 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 347 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  39.29 
 
 		 360 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 346 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 327 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  41.24 
 
 		 330 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 364 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 381 aa  77.4  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 331 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  42.31 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  42.16 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 335 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 353 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 366 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 361 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 353 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 337 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 340 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 336 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 330 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 353 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 324 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 359 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 353 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  34.58 
 
 		 338 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 344 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 353 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 351 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 330 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3459  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195796  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 344 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  47.95 
 
 		 335 aa  73.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 341 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 330 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 341 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 348 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 358 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 336 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  44.87 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>