More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1095 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  79.85 
 
 
134 aa  228  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  79.85 
 
 
134 aa  228  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  79.85 
 
 
134 aa  227  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  76.87 
 
 
134 aa  222  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  55.22 
 
 
132 aa  153  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  54.14 
 
 
134 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  52.63 
 
 
132 aa  144  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  51.88 
 
 
132 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  50 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 
133 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  50.36 
 
 
134 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  52.99 
 
 
133 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 
132 aa  133  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  46.62 
 
 
132 aa  133  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  46.62 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  47.76 
 
 
132 aa  130  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  47.76 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  49.62 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  45.52 
 
 
132 aa  120  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  47.37 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 
146 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  45.11 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 
142 aa  117  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  44.03 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  41.73 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  44.6 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  43.66 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  40.85 
 
 
143 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  43.17 
 
 
142 aa  103  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  45.52 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  46.27 
 
 
137 aa  94  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  33.81 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  33.05 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  35.29 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  36.09 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  34.33 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  34.78 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  33.82 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  37.14 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  37.93 
 
 
128 aa  62  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  39.33 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  40 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  32.06 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  32.82 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  32.17 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  33.04 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  32.06 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  34.35 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  32.61 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  31.82 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  32.31 
 
 
161 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  31.9 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  33.04 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  32.95 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  30.66 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  30.66 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  33.63 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  33.08 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  30.53 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  31.82 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  31.82 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  30.08 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  39.53 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  30.58 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  32.46 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  32.74 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  33.88 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  33.08 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  32.74 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  32.95 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  32.95 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  29.91 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  29.91 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  30.77 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  36.9 
 
 
165 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  30.51 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  30.83 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  30.63 
 
 
174 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  30.77 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  34.78 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  29.91 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  29.91 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  34.83 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  38.46 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  34.48 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  40.48 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  31.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>