More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0800 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  910    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  64.04 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  64.04 
 
 
441 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  63.82 
 
 
437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  59.78 
 
 
438 aa  543  1e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  47.43 
 
 
430 aa  435  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 
435 aa  424  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  43.33 
 
 
444 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 
369 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 
369 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 
369 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
1250 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 
393 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.72 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.28 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.62 
 
 
449 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.21 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.081167  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 
489 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 
444 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0532  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.07 
 
 
457 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.742382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.59 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
552 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3365  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.32 
 
 
452 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0584  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.83 
 
 
469 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.46 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.9 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  26.1 
 
 
476 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.4 
 
 
447 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.28 
 
 
448 aa  90.5  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.12 
 
 
456 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 
487 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.84 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0968  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.92 
 
 
454 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
583 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.72 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.71 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.51 
 
 
479 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.51 
 
 
479 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 
469 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
488 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0865  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.75 
 
 
454 aa  87  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 
518 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.6 
 
 
457 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 
459 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 
528 aa  86.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.28 
 
 
442 aa  86.7  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3339  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
555 aa  86.7  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  26.19 
 
 
501 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.6 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.62 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0651  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  25.41 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0849  RNA modification enzyme, MiaB family  28.71 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  23.56 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.98 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.32 
 
 
451 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.52 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0208  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.28 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 
564 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.78 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
723 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3127  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.09 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00194876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3572  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.95 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2948  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.39 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3527  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.70127  normal  0.0537837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2706  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.92 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.878988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.51 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.92 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899316  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1859  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.89 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0605  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.07 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.13 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.42 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2575  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.64 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.687203  normal  0.0756163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.68 
 
 
554 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3471  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.93 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000111434  normal  0.160126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  23.03 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.57 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3696  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.27 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00523975  hitchhiker  0.00388366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2720  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.27 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0226  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.27 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.703576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  27.6 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2438  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.27 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>