152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2590 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2590  cytochrome c peroxidase family protein, putative  100 
 
 		 773 aa  1585    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.959599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5169  hypothetical protein  37.45 
 
 		 704 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.882011  normal  0.19488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1673  hypothetical protein  34.9 
 
 		 681 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4292  hypothetical protein  41.18 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  52.05 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  40.95 
 
 		 768 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  41.75 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  47.5 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  44.71 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  47.3 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  45.33 
 
 		 365 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  42.5 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  40.7 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  41.18 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  40.48 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  35.9 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  38.14 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  41.98 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  41.46 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  37.8 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  40 
 
 		 333 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 361 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  35.35 
 
 		 390 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  41.98 
 
 		 311 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  42.67 
 
 		 365 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  40.43 
 
 		 390 aa  56.6  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  43.75 
 
 		 348 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 365 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  38 
 
 		 378 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 333 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 333 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  38.89 
 
 		 393 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  42.31 
 
 		 358 aa  56.2  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  40.74 
 
 		 359 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  38.89 
 
 		 333 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  41.67 
 
 		 333 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  37.66 
 
 		 365 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  39.74 
 
 		 352 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  44 
 
 		 333 aa  55.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  39.74 
 
 		 352 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  37.8 
 
 		 304 aa  54.3  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  38.1 
 
 		 353 aa  54.3  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  36.59 
 
 		 304 aa  54.3  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  38.89 
 
 		 330 aa  54.3  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  64.71 
 
 		 468 aa  54.3  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  39.24 
 
 		 339 aa  54.3  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  41.1 
 
 		 343 aa  53.9  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 344 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  34.45 
 
 		 317 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 344 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 344 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  41.03 
 
 		 306 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  40.79 
 
 		 344 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  64.71 
 
 		 413 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  41.56 
 
 		 386 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  38.82 
 
 		 398 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  37.11 
 
 		 342 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  39.08 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  45.21 
 
 		 626 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  42.31 
 
 		 346 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  38.75 
 
 		 398 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  38.83 
 
 		 352 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  39.73 
 
 		 416 aa  52.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  40.54 
 
 		 331 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  40.85 
 
 		 473 aa  52.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  40.26 
 
 		 401 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  40.85 
 
 		 626 aa  51.6  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 331 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0564  Cytochrome-c peroxidase  35.71 
 
 		 607 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  43.84 
 
 		 464 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  35.63 
 
 		 353 aa  51.2  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  35.87 
 
 		 371 aa  51.2  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  39.24 
 
 		 332 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  58.82 
 
 		 454 aa  50.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  39.24 
 
 		 332 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  40.79 
 
 		 314 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  38.16 
 
 		 333 aa  50.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  32.71 
 
 		 387 aa  50.8  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4384  cytochrome-c peroxidase  36.71 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  36.84 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  39.73 
 
 		 368 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  46.48 
 
 		 437 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  44.44 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  42.67 
 
 		 571 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  34.25 
 
 		 353 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  37.04 
 
 		 358 aa  50.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  38.16 
 
 		 352 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  39.47 
 
 		 328 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  39.44 
 
 		 302 aa  50.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2379  Cytochrome-c peroxidase  42.47 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.574362  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  35.06 
 
 		 333 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  36.49 
 
 		 384 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 466 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  37.33 
 
 		 459 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  36.25 
 
 		 355 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 466 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 466 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 466 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>