More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03993 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  46.9 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  43.67 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  43.67 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  43.67 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  43.67 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  42.63 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  43.67 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  43.67 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  43.67 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  43.03 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  43.67 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  42.23 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  46.54 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  46.54 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  43.27 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  45.78 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  48.95 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  40.84 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  43.8 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  45.35 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  42.69 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  41 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  42.26 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  43.83 
 
 		 257 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  46.64 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  46.12 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  47.74 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  47.76 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  40.78 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  40.78 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  40.78 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  46.86 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  41.7 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  44.84 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  47.18 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  41.86 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  40.08 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  40.08 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  40.08 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  37.5 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  39.67 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  40 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  39.91 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  41.7 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  43.85 
 
 		 240 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  46.12 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  36.11 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  37.25 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.87 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  36.25 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  33.48 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  33.91 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  34.94 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  32.03 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  34.39 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  33.07 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  33.07 
 
 		 255 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  38.43 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.84 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  34 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  34 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.76 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  27.02 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  27.02 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.68 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.02 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.42 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  31.43 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.67 
 
 		 558 aa  98.6  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  29.46 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  30.61 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.13 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  30.71 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  28.69 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  26.21 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  26.02 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  25.41 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  25.51 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  26.23 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  27.46 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  27.46 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.87 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>