145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01526 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2423  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  46.72 
 
 		 1044 aa  841    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2353  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1048 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  45.07 
 
 		 1043 aa  778    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1563  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  46.37 
 
 		 1082 aa  845    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1572  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  41.42 
 
 		 1078 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0452612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 1021 aa  720    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  42.35 
 
 		 1063 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3156  hypothetical protein  43.1 
 
 		 1060 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4900  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 1060 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01526  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 931 aa  1922    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  44.05 
 
 		 1032 aa  788    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 999 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12688  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1075 aa  545  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1054 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3021  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.54 
 
 		 1041 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0515  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1147 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  34.62 
 
 		 1084 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1665  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1090 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0910  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 983 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04705  hypothetical protein  29.05 
 
 		 952 aa  287  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0367565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2659  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1220 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  25.25 
 
 		 681 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1806  hypothetical protein  23.11 
 
 		 912 aa  150  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0933525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  22.59 
 
 		 1083 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.85 
 
 		 652 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1117 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.73 
 
 		 630 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3271  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.79 
 
 		 694 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00240388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0367  BNR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 787 aa  91.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.159044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  22.28 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2554  hypothetical protein  22.49 
 
 		 931 aa  82  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521814  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  28.72 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 		 1750 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3051  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.15 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.640117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2405  hypothetical protein  22.73 
 
 		 931 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2318  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1321 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0185432  normal  0.0231077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  27.24 
 
 		 780 aa  77  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1805  BNR repeat domain protein  23.55 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1831  BNR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 350 aa  67.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.511867  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6491  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.22 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6726  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.22 
 
 		 345 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  22.13 
 
 		 337 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1628  BNR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 357 aa  67  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.318821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1755  BNR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 350 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0040563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3988  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.71 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.757519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0463  glycosyl hydrolase  23.91 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2203  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  24.64 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1629  glycosyl hydrolase  22.78 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3393  hypothetical protein  24.48 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  25.35 
 
 		 320 aa  63.9  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1580  glycosyl hydrolase  23.62 
 
 		 357 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.716896  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2681  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  23.94 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2285  hypothetical protein  24.46 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4362  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.76 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.301498  normal  0.0749623 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  23.97 
 
 		 373 aa  62  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1480  glycosyl hydrolase  25.09 
 
 		 347 aa  62  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04767  hypothetical protein  23.24 
 
 		 388 aa  62  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05665  hypothetical protein  23.24 
 
 		 388 aa  62  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0491  hypothetical protein  27.63 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1645  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5629  hypothetical protein  27.63 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1671  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2234  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0564  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.937627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  23.24 
 
 		 404 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  23.24 
 
 		 404 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3424  hypothetical protein  23.21 
 
 		 362 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  23.55 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46750  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151864  decreased coverage  0.000000204614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  21.85 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  23.19 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3522  hypothetical protein  23.96 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0353762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3525  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.24 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.338138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  21.99 
 
 		 1305 aa  58.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4091  hypothetical protein  23.81 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1724  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  23.75 
 
 		 367 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4027  hypothetical protein  24.51 
 
 		 365 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2440  hypothetical protein  22.18 
 
 		 363 aa  57  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.641876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1651  glycosyl hydrolase, BNR repeat  24.14 
 
 		 371 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.879779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1114  hypothetical protein  27.11 
 
 		 323 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  27.71 
 
 		 346 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1409  putative glycosyl hydrolase  24.52 
 
 		 370 aa  55.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.383679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2636  hypothetical protein  21.74 
 
 		 369 aa  54.7  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.463788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  27.83 
 
 		 319 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1821  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.69 
 
 		 378 aa  54.7  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4987  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.39 
 
 		 393 aa  54.7  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2223  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.78 
 
 		 381 aa  54.7  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3192  BNR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3445  BNR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 357 aa  54.3  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1158  hypothetical protein  26 
 
 		 362 aa  54.3  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0409  hypothetical protein  27.8 
 
 		 409 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2905  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.42 
 
 		 363 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.759852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.44 
 
 		 385 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2824  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.1 
 
 		 361 aa  52.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0584586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  27.13 
 
 		 925 aa  52.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>