More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1080 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  769    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  37.85 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
378 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
382 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
401 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
366 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
374 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.64 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
397 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
823 aa  87  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
359 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.58 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  31.01 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  31.36 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.29 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
774 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
774 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.32 
 
 
357 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
767 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  30.12 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  32.22 
 
 
358 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  25.38 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.67 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.32 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  28.26 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
763 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.53 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  29.1 
 
 
759 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.48 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  22.51 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
536 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
666 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  22.88 
 
 
797 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
761 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.48 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
739 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.82 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  20.96 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>