More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0760 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
479 aa  989    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.51 
 
 
503 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.83 
 
 
497 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.92 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  39.72 
 
 
509 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.92 
 
 
509 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.53 
 
 
509 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.76 
 
 
509 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.98 
 
 
509 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.98 
 
 
509 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.51 
 
 
515 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.78 
 
 
793 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.87 
 
 
552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.4 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.54 
 
 
584 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
617 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1569  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 
459 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1538  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38 
 
 
459 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 
706 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.47 
 
 
716 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1049  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.35 
 
 
459 aa  293  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.397749  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 
626 aa  293  6e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.37 
 
 
563 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 
714 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  38.21 
 
 
705 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 
707 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  38.21 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 
705 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 
705 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 
705 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.41 
 
 
633 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 
705 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.58 
 
 
729 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 
705 aa  286  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.1 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.77 
 
 
731 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  42.78 
 
 
637 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  37.19 
 
 
615 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3491  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.98 
 
 
635 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.394167  normal  0.250752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 
733 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.33 
 
 
1376 aa  283  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  37.06 
 
 
493 aa  282  9e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.99 
 
 
617 aa  282  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 
626 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.83 
 
 
602 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.98 
 
 
646 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  38.83 
 
 
724 aa  280  4e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.54 
 
 
598 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.53 
 
 
546 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 
606 aa  280  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.9 
 
 
601 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 
731 aa  279  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.41 
 
 
603 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.28 
 
 
881 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.85 
 
 
728 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  37.73 
 
 
698 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 
709 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.81 
 
 
596 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.57 
 
 
594 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.78 
 
 
725 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 
545 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.73 
 
 
736 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.42 
 
 
543 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.86 
 
 
630 aa  276  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.23 
 
 
543 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.23 
 
 
543 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.47 
 
 
535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.58 
 
 
645 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.19 
 
 
595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  44.18 
 
 
648 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.18 
 
 
662 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.47 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.82 
 
 
595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.55 
 
 
615 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  37.16 
 
 
734 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.84 
 
 
729 aa  273  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.94 
 
 
630 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.65 
 
 
625 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.96 
 
 
527 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.94 
 
 
624 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.88 
 
 
662 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.18 
 
 
611 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 
609 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.97 
 
 
705 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.3 
 
 
607 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.73 
 
 
725 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.88 
 
 
662 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.53 
 
 
451 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.88 
 
 
662 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.1 
 
 
592 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.45 
 
 
674 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 
593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.92 
 
 
593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
609 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  38.95 
 
 
609 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>