260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0298 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0298  ribose-5-phosphate isomerase A  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0296  ribose 5-phosphate isomerase A  59.19 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0159  ribose-5-phosphate isomerase A  57.4 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1750  ribose-5-phosphate isomerase A  61.43 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1183  ribose-5-phosphate isomerase A  55.56 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1611  ribose-5-phosphate isomerase A  55.56 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2538  ribose-5-phosphate isomerase A  53.18 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0154  ribose-5-phosphate isomerase  49.78 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1078  ribose-5-phosphate isomerase A  50.89 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0223389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0630  ribose-5-phosphate isomerase  49.78 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0557  ribose-5-phosphate isomerase A  48.2 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.586546  hitchhiker  0.000000236181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0793  ribose-5-phosphate isomerase  47.93 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0548  ribose 5-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3175  ribose-5-phosphate isomerase A  47.51 
 
 		 262 aa  190  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0883  ribose-5-phosphate isomerase A  46.61 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0359  ribose-5-phosphate isomerase A  47.06 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2003  ribose-5-phosphate isomerase A  46.61 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50995  predicted protein  42.98 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2843  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0251436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1094  ribose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2602  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2554  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1813  ribose 5-phosphate isomerase  42.15 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0762  ribose 5-phosphate isomerase  47.78 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2791  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.091701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2798  ribose-5-phosphate isomerase A  45.37 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000176724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1881  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.806458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2521  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1960  ribose-5-phosphate isomerase A  46.33 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.679373  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2822  ribose-5-phosphate isomerase A  44.91 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2801  ribose-5-phosphate isomerase A  44.55 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0463731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0089  ribose 5-phosphate isomerase  43.44 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0309119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2491  ribose-5-phosphate isomerase A  44.09 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119012  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2910  ribose-5-phosphate isomerase A  40.79 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1349  ribose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.047418  normal  0.22683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2232  ribose-5-phosphate isomerase A  43.1 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184445  normal  0.665669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2596  ribose-5-phosphate isomerase A  45.41 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000910878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3483  ribose-5-phosphate isomerase A  44.1 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.98365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2738  ribose-5-phosphate isomerase A  46.4 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.46075  normal  0.02596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2980  ribose-5-phosphate isomerase A  40.54 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.152582  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2055  ribose-5-phosphate isomerase A  43.97 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3221  ribose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12567  predicted protein  42.44 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2076  ribose-5-phosphate isomerase A  41.38 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.309777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1573  ribose-5-phosphate isomerase A  42.24 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689675  normal  0.86035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0308  ribose 5-phosphate isomerase  44.24 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0129  ribose-5-phosphate isomerase A  43.42 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2013  ribose-5-phosphate isomerase A  42.49 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1010  ribose-5-phosphate isomerase A  41.38 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0976  ribose-5-phosphate isomerase A  41.38 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0309231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2361  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2404  ribose-5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.484551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2092  ribose-5-phosphate isomerase A  41.81 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1459  ribose-5-phosphate isomerase A  41.56 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2769  ribose 5-phosphate isomerase  40.17 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0695  ribose 5-phosphate isomerase  44 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3668  ribose 5-phosphate isomerase  45.33 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03555  ribose-5-phosphate isomerase A  43.36 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3386  ribose-5-phosphate isomerase A  43.1 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2528  ribose-5-phosphate isomerase A  44.65 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.154355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2081  ribose-5-phosphate isomerase A  40.95 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2775  ribose 5-phosphate isomerase  43.32 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2194  ribose-5-phosphate isomerase A  42.06 
 
 		 232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1518  ribose 5-phosphate isomerase A  40.17 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.123747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02745  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0779  ribose 5-phosphate isomerase  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3334  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0378639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3241  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0308705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4210  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0549701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3072  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0011211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0796  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.527616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3047  ribose-5-phosphate isomerase A  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02708  hypothetical protein  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1924  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002480  ribose 5-phosphate isomerase A  42.92 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00368346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2177  ribose 5-phosphate isomerase  43.52 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0548  ribose 5-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.231532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0560  ribose 5-phosphate isomerase  42.61 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0972  ribose-5-phosphate isomerase A  44.2 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.719291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2931  ribose-5-phosphate isomerase A  41.74 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0733  ribose-5-phosphate isomerase A  42.15 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.851526  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1020  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3924  ribose-5-phosphate isomerase A  43.17 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.266536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0519  ribose 5-phosphate isomerase  41.74 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0855  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000367757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4491  ribose-5-phosphate isomerase A  40.93 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0858  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3822  ribose-5-phosphate isomerase A  42.73 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3333  ribose-5-phosphate isomerase A  40.89 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0825  ribose-5-phosphate isomerase A  42.04 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0848  ribose-5-phosphate isomerase A  43.05 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.611603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0602  ribose-5-phosphate isomerase A  38.94 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.590497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16111  ribose-5-phosphate isomerase A  39.91 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2364  ribose-5-phosphate isomerase A  42.22 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18901  ribose-5-phosphate isomerase A  41.63 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3389  ribose-5-phosphate isomerase A  41.48 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1064  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3293  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.272189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3514  ribose-5-phosphate isomerase A  41.67 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1265  ribose 5-phosphate isomerase  40.44 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  0.125756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>