More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3376 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  63.64 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  52.25 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  57.41 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  53.33 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  45.61 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  47.9 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  48.25 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  45.28 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  45.83 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  47.52 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  48 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  46.15 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  46.15 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  46.23 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  47.62 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  48.08 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  46.67 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  46.67 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  43.7 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  47.37 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  41.9 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  48.35 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  43.16 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  36.51 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  43.96 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  43.96 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  43.68 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  38 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  31.19 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  36.27 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  37.29 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  37.29 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  33.85 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  33.33 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  33.59 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0925  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2301  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  35.25 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  29.91 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1432  HSP20/alpha crystallin family protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  32.35 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  32.35 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  31.3 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  25.44 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  32.31 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  36.54 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  35.64 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  30 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  32.76 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  36.27 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  33.9 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  34.65 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2649  heat shock protein Hsp20  31.48 
 
 		 185 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1165  heat shock protein Hsp20  30.1 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>