51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2352 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  69.42 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  58.33 
 
 		 295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  54.01 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  56.52 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  40.62 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  43.75 
 
 		 213 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  34.52 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  36.25 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25.69 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  30.45 
 
 		 281 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  29.05 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  29.69 
 
 		 520 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  33.71 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  28.92 
 
 		 533 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  27.86 
 
 		 526 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  32.65 
 
 		 281 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  26.15 
 
 		 534 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  24.18 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  33.18 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  28.64 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  35.51 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  26.44 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  28.69 
 
 		 476 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  27.94 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  25.49 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  27.51 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  29.29 
 
 		 530 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  26.87 
 
 		 529 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.57 
 
 		 523 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0825  RND family efflux transporter subunit MFP  29.33 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.687604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  23.66 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  30.07 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  26.4 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  26.67 
 
 		 522 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2911  hypothetical protein  28.09 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  30.86 
 
 		 542 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  27.92 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5285  hypothetical protein  24.86 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25.19 
 
 		 496 aa  49.7  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  26.29 
 
 		 528 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  23.18 
 
 		 536 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.36 
 
 		 525 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  23.85 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3595  eight transmembrane protein EpsH  27.15 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2511  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2692  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.863316  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3424  hypothetical protein  27.56 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.46 
 
 		 658 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  25.68 
 
 		 508 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>