More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0754 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  43.31 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  40.36 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.73 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.37 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41.43 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.76 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  44.08 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  41 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  43.08 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  42.62 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.54 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  41.27 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  40.66 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  40.84 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.83 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  41.09 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  40.31 
 
 		 297 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  35.79 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.73 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  37.68 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  43.23 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  41.32 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  39.75 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43.31 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.41 
 
 		 293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.47 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  38 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  36.84 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  40.23 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  35.94 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.69 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  39.86 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  40.08 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  34.86 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  39.39 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  34.51 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  39.47 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  34.51 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  34.51 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  36.52 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.81 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  40.26 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  33.83 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  37.87 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  37.1 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  39.34 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  35.48 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  34.28 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  39.34 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  35.13 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  34.16 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  37.07 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  39.41 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  38.89 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  35.56 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  39.03 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  37.78 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  38.6 
 
 		 297 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  38.66 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  40.95 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  34.89 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0620  Polyprenyl synthetase  39.23 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>