More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0491 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  42.46 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  38.04 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  39.02 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  35.98 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  37.93 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  35.6 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  35.81 
 
 		 263 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 263 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  32.91 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  32.5 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  33.98 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.17 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.2 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.69 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.17 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.77 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  34.15 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  33.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3257  transcriptional regulator, DeoR family  29.58 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.9425  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  30.63 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  31.84 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.09 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.09 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  30.38 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.09 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.09 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  30.51 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  33.49 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.41 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.09 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.74 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  30.95 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  29.96 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.72 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  28.28 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.86 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.86 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  29.67 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  30.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  35.86 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.65 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  32.19 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.37 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  32.74 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  32.19 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.51 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.19 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>