More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2348 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2348  amidase  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  49.16 
 
 
187 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
181 aa  168  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  45.86 
 
 
185 aa  164  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  46.37 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  46.37 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  44.69 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  46.11 
 
 
187 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.11 
 
 
187 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  46.11 
 
 
187 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  45.56 
 
 
187 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  44.13 
 
 
187 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  44.13 
 
 
187 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  44.13 
 
 
187 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 
181 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  45.25 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  42.7 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  41.14 
 
 
193 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  40.57 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 
184 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  39.18 
 
 
199 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 
182 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
182 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 
182 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  38.76 
 
 
228 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 
316 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  38.99 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 
182 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  38.78 
 
 
316 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30 
 
 
181 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.4 
 
 
182 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
187 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  35.93 
 
 
210 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
185 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0384  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
313 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 
207 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2121  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.29808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.73 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  35.23 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  36.21 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  36 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  35.63 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.43 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  95.5  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.43 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.43 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 
231 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
172 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  37.75 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
231 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.86 
 
 
359 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 
231 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  34.86 
 
 
359 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
289 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
231 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 
216 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  31.82 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 
164 aa  89  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
199 aa  89  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1247  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127255  normal  0.527652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 
180 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 
180 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 
177 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 
180 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.34 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  30.46 
 
 
198 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
190 aa  84.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.03 
 
 
198 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  33.53 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0975  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.8451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>