More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0902 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  53 
 
 		 594 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  54.49 
 
 		 594 aa  680    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  62.91 
 
 		 593 aa  830    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  54.17 
 
 		 594 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  54.33 
 
 		 594 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  54.33 
 
 		 594 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  54.33 
 
 		 594 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  50.95 
 
 		 593 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  54.02 
 
 		 596 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  54.33 
 
 		 594 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  54.33 
 
 		 594 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  54.65 
 
 		 594 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  54.17 
 
 		 594 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  50.95 
 
 		 593 aa  637    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  54.57 
 
 		 591 aa  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  54.02 
 
 		 594 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 658 aa  1362    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  63.62 
 
 		 595 aa  825    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  52.52 
 
 		 590 aa  678    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  45.45 
 
 		 610 aa  585  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  43.15 
 
 		 603 aa  534  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  43.34 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0871  excinuclease ABC subunit C  42.48 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  42.9 
 
 		 599 aa  511  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  40.97 
 
 		 607 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  38.55 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  38.7 
 
 		 620 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 625 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.01 
 
 		 607 aa  422  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 		 613 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 593 aa  415  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 		 624 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  37.62 
 
 		 616 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  37.73 
 
 		 616 aa  399  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  36.17 
 
 		 614 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 631 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  34.91 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.34 
 
 		 622 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 628 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 		 653 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 627 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.39 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  34.94 
 
 		 685 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.33 
 
 		 641 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  35.41 
 
 		 613 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.12 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  35.36 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  35.52 
 
 		 652 aa  363  7.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  34.46 
 
 		 636 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  33.13 
 
 		 611 aa  357  5e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  33.96 
 
 		 628 aa  354  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  34.92 
 
 		 649 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  34.2 
 
 		 612 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.69 
 
 		 623 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0424  excinuclease ABC subunit C  34.03 
 
 		 584 aa  350  7e-95  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.621059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 616 aa  349  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  32.49 
 
 		 613 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1993  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 604 aa  343  7e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  32.93 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  35.75 
 
 		 615 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0024  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 596 aa  340  5e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 		 599 aa  339  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  35.52 
 
 		 521 aa  339  8e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  33.9 
 
 		 609 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  32.86 
 
 		 596 aa  337  5.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  32.66 
 
 		 599 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.11 
 
 		 656 aa  335  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  34.59 
 
 		 666 aa  334  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  32.04 
 
 		 613 aa  333  7.000000000000001e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  33.54 
 
 		 620 aa  332  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  34.53 
 
 		 708 aa  332  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  33.83 
 
 		 671 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  33.78 
 
 		 643 aa  330  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 		 609 aa  330  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  32.65 
 
 		 707 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 695 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  33.93 
 
 		 737 aa  329  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  31.99 
 
 		 635 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  33.94 
 
 		 649 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  32.58 
 
 		 695 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0726  excinuclease ABC subunit C  32.54 
 
 		 597 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  32.65 
 
 		 649 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  33.68 
 
 		 682 aa  325  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  32.46 
 
 		 668 aa  324  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0387  excinuclease ABC, C subunit  33.07 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.971851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  32.82 
 
 		 610 aa  324  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  33.03 
 
 		 626 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>