281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14740 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  52.7 
 
 
260 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  52.28 
 
 
250 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  50.83 
 
 
242 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  51.04 
 
 
243 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  50.62 
 
 
243 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  47.72 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  47.72 
 
 
264 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  47.13 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  46.86 
 
 
260 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  47.92 
 
 
244 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  46.03 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  45.23 
 
 
243 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  46 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  41.98 
 
 
246 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  40.33 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  28.91 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.65 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  35.54 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  29.14 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  29.19 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.85 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  38.53 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.07 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  27.54 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  29.85 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.29 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  35.51 
 
 
276 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.96 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  27.94 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  25.83 
 
 
511 aa  59.3  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  35.64 
 
 
535 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  25.93 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  32.08 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  29.61 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  31.29 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  27.43 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  32.9 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  25 
 
 
188 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  29.75 
 
 
506 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  32.96 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  26.8 
 
 
508 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.65 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  26.94 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  30.19 
 
 
512 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  33.66 
 
 
516 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  36.28 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  25.17 
 
 
507 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  32 
 
 
512 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  26.28 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  31.02 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  37.07 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  27.16 
 
 
522 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  29 
 
 
512 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.33 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  29.36 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  30.41 
 
 
238 aa  52  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  27.16 
 
 
242 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  27.16 
 
 
522 aa  52  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  32.89 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  29.03 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  33.02 
 
 
533 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  23.33 
 
 
510 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.14 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.28 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.76 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  31.31 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  27.83 
 
 
513 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  28.21 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  25 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  22.64 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  26.67 
 
 
508 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  22.64 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  27.36 
 
 
510 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  22.64 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  24.56 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  27.22 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  30.56 
 
 
529 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  31.53 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  28.04 
 
 
509 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>