More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4236 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  100 
 
 		 494 aa  906    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 482 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  40.96 
 
 		 517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  40.42 
 
 		 539 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  44.87 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  44.87 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  45.09 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  43.01 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  41.26 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  43.37 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 541 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  42.74 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  43.27 
 
 		 475 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.91 
 
 		 656 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.34 
 
 		 605 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.54 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  27.22 
 
 		 467 aa  196  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  37.71 
 
 		 526 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.99 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.27 
 
 		 531 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.62 
 
 		 810 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  26.59 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.54 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  32.67 
 
 		 553 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.08 
 
 		 497 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  26.54 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.7 
 
 		 495 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  26.54 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  29.47 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.3 
 
 		 571 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.79 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.35 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.31 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.83 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 551 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.56 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.05 
 
 		 764 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.07 
 
 		 770 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.77 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.21 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  24.22 
 
 		 566 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.89 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.09 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.36 
 
 		 568 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  33.72 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.01 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.21 
 
 		 593 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  24.17 
 
 		 568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.66 
 
 		 548 aa  156  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.72 
 
 		 541 aa  156  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.14 
 
 		 501 aa  156  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  29.47 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.15 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  29.04 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.4 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.31 
 
 		 500 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  29.46 
 
 		 628 aa  152  8.999999999999999e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.71 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.94 
 
 		 551 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.62 
 
 		 811 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.56 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.43 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.53 
 
 		 1091 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.44 
 
 		 582 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.07 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.66 
 
 		 576 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  31.55 
 
 		 571 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 540 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  35.63 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.42 
 
 		 543 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 553 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.43 
 
 		 568 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.11 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.14 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.26 
 
 		 497 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  28.43 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.06 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  32.78 
 
 		 498 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.96 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25 
 
 		 593 aa  143  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.38 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.88 
 
 		 590 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.74 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.6 
 
 		 574 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  28.99 
 
 		 482 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.18 
 
 		 473 aa  139  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  28.06 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  33.46 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.16 
 
 		 558 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.21 
 
 		 495 aa  136  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  31.86 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  32.43 
 
 		 621 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 234 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>