More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4044 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.62 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  35.32 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  38.25 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  33.48 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.59 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  25.59 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  36.07 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.2 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0830  transcriptional regulator, LysR family  42.38 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.0341942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.83 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5074  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.507053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.76 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.76 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1615  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.760983  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>