More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3939 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 465 aa  844    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  50 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  43.52 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  43.27 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 464 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 504 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.59 
 
 		 462 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 469 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  39.36 
 
 		 495 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  31.72 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 462 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  38.07 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  37.39 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 491 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 497 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  30.32 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 495 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.78 
 
 		 535 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0847  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362439  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 		 565 aa  90.5  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 531 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.39 
 
 		 565 aa  89.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3297  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  35.81 
 
 		 501 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0173  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2384  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.7 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2775  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.7 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.847673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.22 
 
 		 517 aa  86.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2304  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.7 
 
 		 549 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.55 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0669  putative multidrug transporter  28.7 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 549 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  35.81 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0653  putative multidrug transporter  28.7 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.433513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 531 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0637  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2150  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  29.85 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 697 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 538 aa  77.4  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  28.21 
 
 		 548 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.29 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2444  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 621 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7236  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.27 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0485  major facilitator superfamily MFS_1  31.26 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>