151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3679 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
375 aa  735    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  28.76 
 
 
364 aa  130  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  32.93 
 
 
350 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  29.43 
 
 
349 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  27.66 
 
 
361 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  32.83 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  32.63 
 
 
503 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  32.51 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  33.95 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  29.13 
 
 
332 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07270  hypothetical protein  20.74 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.417127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1369  hypothetical protein  24.75 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  30.41 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  26.94 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
381 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  31.43 
 
 
384 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
372 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.57 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
435 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
401 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1580  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
398 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.04 
 
 
390 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
448 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  30.08 
 
 
480 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
366 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
451 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
660 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  28.16 
 
 
564 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
357 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  31.65 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  24.87 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  30.7 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  38.39 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
403 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
448 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.01 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
355 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.97 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  42.39 
 
 
378 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
376 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
417 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  26.54 
 
 
430 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
392 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
424 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  36.45 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
346 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0701  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
482 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
401 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>