18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4490 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  30.41 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  30.8 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  29.36 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0743  putative glycosyl transferase  40.52 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136224  hitchhiker  0.00617937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.74 
 
 		 364 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  29.59 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  30.32 
 
 		 503 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 379 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  24.09 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 		 405 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.44 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>