67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3496 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3496  Zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  100 
 
 		 503 aa  969    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3140  zinc carboxypeptidase A metalloprotease (M14)  97.48 
 
 		 357 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0299032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0590  glycosyl transferase, group 1  37.88 
 
 		 380 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  29.37 
 
 		 364 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 360 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 		 375 aa  87  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07270  hypothetical protein  22.67 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.417127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  36.51 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  27.42 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.58 
 
 		 384 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4490  hypothetical protein  31.7 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 930 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  35.66 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 379 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.11 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01399  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumI  27.49 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.490868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  22.71 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 366 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 381 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 378 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 		 374 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  18.25 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  23 
 
 		 381 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.8 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 800 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 365 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2185  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.81 
 
 		 458 aa  43.9  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  22.42 
 
 		 432 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 		 380 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 399 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>