90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2069 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  342  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  52.17 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  50.97 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  51.7 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  45.83 
 
 		 516 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  48.1 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  44.3 
 
 		 825 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  46.75 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  45.4 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  48.05 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  48.03 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  38.61 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  39.76 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  48.72 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  43.24 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  35.19 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  46.54 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  37.97 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  41.88 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  37.97 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  37.97 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  40.62 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  44.03 
 
 		 520 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  32.93 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  44.76 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  37.34 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  39.38 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  34.06 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  38.81 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  37.5 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  34.59 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  31.71 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  39.05 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  36.59 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  31.21 
 
 		 633 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  32.86 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  30.13 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  42.86 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  29.19 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  28.65 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  29.56 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  30.28 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  30.28 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  29.58 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  30.5 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  30.28 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  35.79 
 
 		 478 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  29.08 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  28.82 
 
 		 665 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5814  hydroxyisourate hydrolase  35.12 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  28.37 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3212  OHCU decarboxylase  34.38 
 
 		 294 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  29.08 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  35.09 
 
 		 471 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  28.57 
 
 		 589 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0035  putative uricase  29.11 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  27.85 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  32.73 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.4 
 
 		 592 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  29.08 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  33.04 
 
 		 470 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.68 
 
 		 589 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.91 
 
 		 599 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  29.49 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0215  OHCU decarboxylase  29.19 
 
 		 292 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.0296602 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00070  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531908  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  29.21 
 
 		 640 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.24 
 
 		 475 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  32.69 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.35 
 
 		 592 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  33.8 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.95 
 
 		 593 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  31.85 
 
 		 599 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.85 
 
 		 592 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  29.91 
 
 		 475 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  29.91 
 
 		 475 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  30.13 
 
 		 174 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  27.43 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  36.11 
 
 		 470 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  36.11 
 
 		 470 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  33.01 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  26.95 
 
 		 173 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>