More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2484 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 474 aa  932    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  53.42 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  40.93 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  49.66 
 
 		 540 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  41.56 
 
 		 425 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  40.37 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  42.07 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  38.13 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  34.84 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  32 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  30.4 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.98 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  31.55 
 
 		 422 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  33.06 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  29.06 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  28.65 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  29.9 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  31.82 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  29.17 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  30.51 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  24.87 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  31.44 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  31.44 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  31.44 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  31.37 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  26 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  29.54 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  29.1 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  29.01 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  30.17 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  26.63 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  29.2 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  28.68 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  26.37 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  26.49 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  25.48 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.49 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  23.7 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  25.37 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.24 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  25.14 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  29.06 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  23.4 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 458 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 422 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  29.75 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1368  glutamyl-tRNA reductase  23.32 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  23.36 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  23.38 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  29.64 
 
 		 501 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  26.13 
 
 		 418 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  26.32 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  31.33 
 
 		 425 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  22.22 
 
 		 421 aa  96.7  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  24.93 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  25.5 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  24.48 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  26.8 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  23.17 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6499  glutamyl-tRNA reductase  24.19 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.595047 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  30.22 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  27.07 
 
 		 340 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  24.81 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 432 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 432 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  24.92 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  26.18 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  23.67 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  26.18 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  27.73 
 
 		 434 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  22.67 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  22.67 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  26.02 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  25.26 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  26.5 
 
 		 440 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>