More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3248 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 540 aa  1045    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  39.54 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  54.12 
 
 		 502 aa  266  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  52.83 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  48.47 
 
 		 441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  45.1 
 
 		 440 aa  200  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  46.86 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  45.11 
 
 		 450 aa  179  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  42.02 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  37.16 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  34.87 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  33.21 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  35.11 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  33.8 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.88 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  33.46 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  33.84 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 443 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  33.46 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  31.94 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  30.59 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  33.46 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 477 aa  102  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  31.78 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 435 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  34.63 
 
 		 440 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.5 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  30.38 
 
 		 419 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 		 422 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 432 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  28.85 
 
 		 444 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  29.07 
 
 		 418 aa  97.8  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  32.88 
 
 		 340 aa  97.4  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 432 aa  97.4  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  31.18 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  32.82 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 444 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 501 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  28.08 
 
 		 444 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.67 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5475  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 		 441 aa  94.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 		 454 aa  93.6  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  27.31 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  30.47 
 
 		 424 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  29.89 
 
 		 416 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  32.2 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1456  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 414 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1855  glutamyl-tRNA reductase  31.01 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163682  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  32.53 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  32.57 
 
 		 446 aa  90.9  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  28.74 
 
 		 422 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 424 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 426 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  28.74 
 
 		 422 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  30.23 
 
 		 418 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  31.42 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 473 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  30.34 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 		 451 aa  90.1  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  27.31 
 
 		 443 aa  90.1  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  29.62 
 
 		 421 aa  90.1  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  30.11 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  28.94 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  32.16 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  28.94 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.56 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  32.88 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  32.09 
 
 		 449 aa  89.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2525  glutamyl-tRNA reductase  28.9 
 
 		 331 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3663  glutamyl-tRNA reductase  31.53 
 
 		 432 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.216962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>