More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2773 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2495  glutamyl-tRNA reductase  89.04 
 
 		 441 aa  749    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2773  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 440 aa  873    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15240  glutamyl-tRNA reductase  52.8 
 
 		 450 aa  388  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.574725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36020  glutamyl-tRNA reductase  40.41 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.799704  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3434  glutamyl-tRNA reductase  42.86 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627515  hitchhiker  0.00368913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1549  glutamyl-tRNA reductase  39.2 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.214578  normal  0.338338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2484  Glutamyl-tRNA reductase  40.37 
 
 		 474 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.682056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4009  glutamyl-tRNA reductase  39.55 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  33.97 
 
 		 500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3248  Glutamyl-tRNA reductase  43.53 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.696727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  34 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  31.39 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  33.97 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  35.53 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  30.41 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  32.81 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  32.41 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  31.89 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  32.44 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  30.15 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  30.21 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  30.37 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  29.7 
 
 		 465 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  29.83 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  29.09 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  31.48 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  28.46 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.54 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  28.97 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  29.24 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  28.27 
 
 		 449 aa  126  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  26.91 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  25.59 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  30.8 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.23 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  25.24 
 
 		 454 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  28.19 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  25.89 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  23.81 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  26.87 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  26.87 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  26.87 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  26.87 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  27.57 
 
 		 418 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  27.9 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  28.84 
 
 		 422 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  25.99 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  27.11 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  26.61 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  28.04 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  26.83 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  26.97 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.82 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.75 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  28.21 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  25.54 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  24.94 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  25.73 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  26.58 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  27.92 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  26.84 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.11 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  25.75 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  26.84 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>