More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0238 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 473 aa  925    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  49.54 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  49.42 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  46.07 
 
 		 468 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  46.82 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  47.76 
 
 		 456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  45.68 
 
 		 445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  45.95 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  47.34 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  48.49 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  44.09 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  42.74 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  45.52 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  46.39 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  44.23 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  42.95 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  46.24 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  44.02 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  44.44 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  42.45 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  37.05 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  31.75 
 
 		 458 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 446 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  30.43 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  30.71 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  30.48 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  30.79 
 
 		 443 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.29 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  30.24 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  30.31 
 
 		 434 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  35.14 
 
 		 425 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 		 443 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  35.08 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.38 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  30.73 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  35.04 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  28.87 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  28.87 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.62 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  30.02 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 414 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  34.28 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  30.97 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  32.1 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.62 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.55 
 
 		 442 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  32.17 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  31.02 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  31.36 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  32.42 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 450 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  31.53 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  30.95 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  29.86 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  31.21 
 
 		 446 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  31.67 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  34.4 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  27.97 
 
 		 428 aa  187  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  31.64 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  28.84 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  30.61 
 
 		 432 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>